- Phương pháp nuôi cấy:
- Phương pháp đổ đĩa (pour plate)
- Phương pháp đếm khuẩn lạc trên ống thạch
- Phương pháp cấy bề mặt (spread)
- Phương pháp MPN (most probable number)
- Phương pháp màng lọc
- Phương pháp nuôi cấy kỵ khí
- Phương pháp đếm trực tiếp
- Phương pháp trên cơ sở vật lý:
- Phương pháp đo mật độ quang