Phân tích hệ vi sinh vật (microbiome) bằng kỹ thuật giải trình tự gen 16S rRNA là một trong những ứng dụng quan trọng của công nghệ giải trình tự thế hệ mới (Next-Generation Sequencing – NGS). Phương pháp này cho phép nhận diện và định danh các vi sinh vật không nuôi cấy được, giúp khảo sát thành phần vi sinh vật trong các mẫu sinh học như phân, nước bọt, da, môi trường, thực phẩm, và nhiều hệ sinh thái khác. Trong lĩnh vực y học và nghiên cứu sức khỏe cộng đồng, phân tích microbiome đang ngày càng được quan tâm vì mối liên hệ chặt chẽ giữa hệ vi sinh vật với sức khỏe, bệnh lý, đáp ứng điều trị và dự phòng bệnh.
Nhằm cung cấp các kiến thức nền tảng và kỹ năng thực hành phân tích dữ liệu microbiome giải bằng kỹ thuật NGS cho cộng đồng khoa học và y tế, Trung tâm Khoa học và Công nghệ Sinh học phối hợp cùng Khoa Sinh học – Công nghệ Sinh học (Trường ĐH KHTN, ĐHQG-HCM) khóa học với các thông tin sau:
Mục tiêu đào tạo
- Kiến thức: Hiểu rõ nguyên tắc và các ứng dụng của kỹ thuật giải trình tự thế hệ mới trong phân tích thành phần vi sinh trong mẫu thông qua trình tự 16S rRNA.
- Kỹ năng: Thực hiện được các thao tác trong quy trình xử lý và phân tích dữ liệu giải trình tự thế hệ mới của mẫu giải short-read trình tự 16S của mẫu microbiome, bao gồm bước đánh giá, cải thiện chất lượng dữ liệu, định danh các ASV, tính các chỉ số đa dạng và thực hiện kiểm định.
- Thái độ: Nhận thức được vai trò và tiềm năng của kỹ thuật giải trình tự thế hệ mới trong phân tích thành phần vi sinh trong mẫu.
Thông tin khóa học
- Hình thức đào tạo: Tập trung
- Thời gian học: 4,5 ngày (45 tiết)
- Địa điểm: Trường Đại học Khoa học tự nhiên, 227 Nguyễn Văn Cừ, P. Chợ Quán, Q.5, TP.HCM.
- Số lượng học viên: 10 – 20 học viên/khóa.
Nội dung khóa học
| Thời gian | Nội dung | Thời lượng |
| Ngày 1 | Chuyên đề 1: Ứng dụng NGS vào nghiên cứu Microbiome | Sáng (5 tiết LT) |
| TH 1: Giới thiệu nền tảng Galaxy và quy trình tổng quát | Chiều (5 tiết TH) | |
| Ngày 2 | TH 2: Đánh giá chất lượng dữ liệu & Tinh sạch dữ liệu | Sáng (5 tiết TH) |
| TH 3: Định danh thành phần hệ vi sinh | Chiều (5 tiết TH) | |
| Ngày 3 | TH 4: Tính chỉ số độ đa dạng alpha và beta | Sáng (5 tiết TH) |
| TH 5: Trực quan hóa các dữ liệu bằng biểu đồ | Chiều (5 tiết TH) | |
| Ngày 4 | TH 6: So sánh các mẫu, tiến hành kiểm định | Sáng (5 tiết TH) |
| Thảo luận và Đánh giá | Chiều (5 tiết TH) | |
| Ngày 5 | Chuyên đề 2: Nghiên cứu microbiome trong thực tiễn | Sáng (5 tiết LT) |
| Tổng kết | Chiều |
Học phí và Ưu đãi
- Học phí gốc: 5.000.000 VNĐ/học viên.
- Chính sách ưu đãi:
- Giảm 50%: Sinh viên Khoa Sinh học – Công nghệ Sinh học, Trường ĐH KHTN.
- Giảm 30%: Học sinh, sinh viên các đơn vị khác.
- Giảm 20%: Học viên cao học và cán bộ thuộc Khoa Sinh học – Công nghệ Sinh học, Trường ĐH KHTN.
Thông tin liên hệ
- Trung tâm Khoa học và Công nghệ Sinh học: 227 Nguyễn Văn Cừ, Quận 5, TP. HCM.
- Zalo: 0918.090.838
- Email: cbb.service@hcmus.edu.vn